一、借款合同中主债务的诉讼时效
对于借款合同者主债务的诉讼时效，应适用我国《民法通则》关于普通诉讼时效的规定，期间为2年，对于当事人间约定了还款日期的，诉讼时效期间的起诉点应为该还款之日;未约定还款日期的，从权利人可行使权利之时起算，但从借款之日起超过20年的，不再予以保护。在分期偿还的借款，则每一笔有明确履行期限的还款在到期之日即单独起算该笔借款的诉讼时效。至于主债务诉讼时效的中止、中断以及延长皆适用《民法通则》的有关规定。
二、实务中涉及诉讼时效的几个难点问题
1、权利人起诉后又自动撤诉，或权利人向人民法院提起诉讼，被法院裁定不予受理或者驳回起诉的，诉讼时效是否中断?
有些学者认为，我国《民法通则》仅是规定了提起诉讼引起的诉讼时效中断，只要有诉讼这一行为，就说明权利人没有放弃权利，亦非怠于行使权利，只是某种原因出现致使其撤诉而已。也有些学者认为起诉后又自动撤诉的，是权利人否定了先前权利的行使，应视为对由起诉而生的法律效力的抛弃的意思表示，诉的撤回，视为未起诉。所以不产生诉讼时效的中断，因此，第二种学者的已经较为合理，但是如起诉状副本已由法院送达被告，原告撤回起诉，此时，虽法院尚未作出判决，但也可视为权利人的请求到达于对方当事人，可引起诉讼时效的中断。
若权利人提起诉讼后，被人民法院裁定不予受理或者驳回起诉的，应根据具体情况而定，若权利人向没有管辖权的人民法院起诉，被人民法院通知不予受理，并且被告知有管辖权的人民法院起诉，或者直接被裁定不予受理，或者发现立案后该法院没有管辖权，或者直接被裁定不予受理，或者发现立案后该法院没有管辖权，而被移送到有管辖权的人民法院，或被裁定驳回起诉，在此情况下，虽权利人起诉的事实本身说明权利人在积极行使权利，因此诉讼时效应当中断，中断溯及力至权利人第一次提起诉状之日，若诉讼时效不中断，则可能发生权利人向有管辖权的人民法院起诉时或者受移送人民法院收到起诉状时已超过诉讼时效的情形，若以此为由认定权利人丧失胜诉权，则未免对权利人要求过于严格，而按照我国《民事诉讼法》的规定，起诉对象错误，或者诉讼请求没有依据或者诉讼请求不明确，不合法，而被人民法院驳回起诉或者不予受理的，则诉讼时效不中断，因为上述情况系权利人自身不恰当或者不合理的行使自己的权利所致，故不利后果应由权利人承担。
2、请求的方式
(1)请求的表达方式应尽量合法、适当。请求为法律行为，因此请求的作出应符合法律行为的成立要件及有效要件。在实务中，主要是请求方式的合法性与妥当性。所谓合法，即请求不得违背法律规定得强制性规定，所谓妥当，即不得有害于公诉良俗，采取非法的手段。如在债务住所附近住所张贴大字报，对债务人采取胁迫，非法扣押财产的行为方式，这些行为不得引起诉讼时效的中断的后果。但是银行在贷款到期后，直接从贷款人账户上扣划贷款本息的行为能否引起诉讼时效的中断，具体应分为两种情况而论，一种是银行与贷款人在贷款合同中没有约定，贷款到期后，银行可以从贷款人账户中直接划款用于偿还还款贷款本息，在这种情况下，银行无权扣划款项，我国《商业银行法》规定，商业银行应当保障存款人的.合法权益，不受任何单位或个人的侵犯。商业银行在没有法律依据的情况下，直接从贷款人账户扣划款项，其行为违法了法律的强制性规定，因此，扣划行为无效，并不能中断贷款的诉讼时效。二种、若银行与贷款人在借款合同中约定了在贷款到期后，贷款人不及时偿还借款，银行可以从贷款人账户中直接扣划贷款本息，在此情形下，因贷款人对自己账户内的资金有处分权，其以合意的方式授予银行扣划存款的权利的行为应为有效，则银行的扣划行为可以视为是主张权利，从而引起诉讼时效的中断。
(2)权利人提出请求，主张权利的行为是否必须义务人知晓?在实务中，要求权利人举证的义务人知晓是很困难的，义务人往往以不知道为借口，利用时效制度达到逃避债务的目的，因此，只要权利人有确切的证据证明其以适当的合法方式作出请求，即应引起诉讼时效的中断，例如以挂号信方式寄出请求履行的通知并经公证机关证明。
(3)请求一部分债权，其他部分的诉讼时效是否引起中断?对于这一问题的观点也是存在两种：一是请求为意思表示，只有主张全部债权时，始可中断全部债权的时效，而另一种观点则认为，请求为主张权利，主张一部分的债权即是主张权利，亦是中断其余部分的时效，因此实务中，主张权利主要作为证据在诉讼中使用，只有权利人主张了权利，皆可以认为全部债权时效得以中断。
三、诉讼时效届满后，义务人为承认，或与权利人重新达成协议，应如何进行处理?
实务中，往往出现这样的情况，诉讼时效届满后，义务人或做出承认，又或是与权利人签订新的偿还协议。遇到这种情绪，应具体分析：
诉讼时效期间届满后，义务人对原债务人作出承认的，可分为两种情形。